如果被告不主张已超出诉讼时效，法院不得自行适用诉讼时效规定；如果被告主张已超出诉讼时效，法院应驳回原告的诉讼请求。
根据最高人民法院《民事案件案由规定(试行)》的规定，医疗事故的案由有两种，一种是侵权，一种是合同，相应的诉讼时效，按侵权是1年，按合同是3年。医疗事故诉讼时效的起始时间是从知道或应该知道损害或医疗服务合同违约开始计算。
《民法通则》第137条规定：诉讼时效从知道或者应当知道权利被侵害时计算。但是，从权利被侵害之日起，超过20年的，人民法院予保护。