根据保证金的性质不同，不退还保证金的处理方式也不同，解决不退还保证金争议的部门也有所不同。
一、如果是取保候审的保证金的，可以向决定取保候审的机关申诉，或者向上级机关、检察院投诉。
取保候审保证金是指符合取保候审条件的取保候审人，为保证其不妨碍、不逃避刑事诉讼活动，而交纳的一定数额的现金。人民法院、人民检察院和公安机关决定对犯罪嫌疑人、被告人取保候审，应当责令犯罪嫌疑人、被告人提出保证人或者交纳保证金。
犯罪嫌疑人在取保候审期间，没有违反规定的情况，那么在取保候审到期之后，公安机关应当将保证金如数退还给犯罪嫌疑人。
二、如果是合同约定的保证金，另一方违约不退还的情况下，可以限行与对方协商，协商不成的可以请人民调解组织进行调解，也可以直接整理证据去法院起诉处理的。
那么去法院起诉时需要满足的条件有哪些呢？
1.原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
2.有明确的被告；
3.有具体的诉讼请求和事实、理由；
4.属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
法律依据：
《刑事诉讼法》第七十二条　【保证金数额的确定及缴纳】取保候审的决定机关应当综合考虑保证诉讼活动正常进行的需要，被取保候审人的社会危险性，案件的性质、情节，可能判处刑罚的轻重，被取保候审人的经济状况等情况，确定保证金的数额。
提供保证金的人应当将保证金存入执行机关指定银行的专门账户。
第七十三条　【保证金退还】犯罪嫌疑人、被告人在取保候审期间未违反本法第七十一条规定的，取保候审结束的时候，凭解除取保候审的通知或者有关法律文书到银行领取退还的保证金。
《民事诉讼法》第一百二十二条　起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。