公司拖欠工程款的处理：1、通过电话和函件收取。经常给施工单位打电话询问工程款支付进度，并注意做好记录工作，以防对方钻法律空子，提前保留证据；2、亲自到对方公司领取；3、如果精力有限，可以委托专业律师处理；4、委托正规合法的讨债公司代收；5、向法院提起诉讼，提供担保，冻结对方资产。
那么拖欠工程款违约金怎么算？
当计算拖欠工程款的违约金时，可以从以下三个方面进行考虑：
（一）违约责任取决于合同约定和法律规定，且约定优先。
（二）违约金有约定按约定，没有约定的，参照实际损失计算。
（三）当事人没有约定利息而约定了迟延付款违约金的情况下如何处理。所以，合同中约定违约责任并明确违约金具体数额的，从其约定;如果没有约定，按照法律规定处理，收取定金一方违约的，双倍返还定金。双方都有过错的，按照各自过错程度分担。违约金不足以弥补损失的，可以要求违约方按对方所受损失进行赔偿;违约金过高的也可以请求减少赔偿金额。综上所述您清楚了吗？
根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。