夫妻双方不在一个户口本上没有影响。但是一方想要把户籍迁到另一方户口本上具体流程如下：1、一方需要到迁入地派出所开具准迁证；2、再到原户口所在地派出所办理迁移证;3、最后到迁入地派出所办理迁入手续。根据我国相关法律规定可以知道，公民迁出本户口管辖区，由本人或者户主在迁出前向户口登记机关申报迁出登记，领取迁移证件，注销户口。公民由农村迁往城市，必须持有城市劳动部门的录用证明，学校的录取证明，或者城市户口登记机关的准予迁入的证明，向常住地户口登记机关申请办理迁出手续。公民迁往边防地区，必须经过常住地县、市、市辖区公安机关批准。

那么夫妻户口不在一起算几户？
户口登记以户为单位。同主管人共同居住一处的立为一户，以主管人为户主。单身居住的自立一户，以本人为户主。居住在机关、团体、学校、企业、事业等单位内部和公共宿舍的户口共立一户或者分别立户。
综上所述，夫妻户口不在一起没有影响，您清楚了吗？