证明夫妻已经分居两年应准备如下材料：

1、一方在外居住的房屋租赁合同;

2、双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认;

3、一方向另一方发出的书面分居文书;

4、双方来往的书信、电子邮件、聊天记录等能证明双方感情不和分居的事实。

5、证人证言。

【法律依据】

《中华人民共和国婚姻法 》第三十二条,男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：(一)重婚或有配偶者与他人同居的;(二)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的;(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改的;(四)因感情不和分居满二年的;(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。