医疗机构如果侵犯患者知情权导致患者权益受损的有关部门应该严格按照相应的法律法规和部门规章制度，严肃处理，追究其民事、行政责任，甚至刑事责任，并承担相应的赔偿。

根据法律规定患者的知情权主要包括患者对医疗行为的知情权，对医疗费用知情权，对医疗资料知情权以及对医疗争议知情权。