实行招标、拍卖、公开协商等方式承包农村土地的，按照下列程序办理农村土地承包经营权证：

第一，土地承包合同生效后，承包方填写农村土地承包经营权登记申请书，报承包土地所在乡(镇)人民政府农村经营管理部门。

第二，乡(镇)人民政府农村经营管理部门对发包方和承包方的资格、发包程序、承包期限、承包地用途等予以初审，并在农村土地承包经营权证登记申请书上签署初审意见。

第三，承包方持乡(镇)人民政府初审通过的农村土地承包经营权登记申请书，向县级以上人民政府申请农村承包经营权证登记。

第四，县级以上地方人民政府农业行政主管部门对登记申请予以审核。申请材料符合规定的；

编制农村土地承包经营权证登记簿，报请同级人民政府颁发农村土地承包经营权证;申请材料不符合规定的，书面通知申请人补正。

第五，乡(镇)人民政府农村经营管理部门领取农村土地承包经营权证后，应在30个工作日内将农村土地承包经营权证发给承包方。发包方不得为承包方保存农村土地承包经营权证。

【法律依据】

根据《农村土地承包法》的规定，通过家庭承包取得的土地承包经营权可以依法采取转包、出租、互换、转让或者其他方式流转；通过招标、拍卖、公开协商等方式承包农村土地，经依法登记取得土地承包经营权证或者林权证等证书的，其土地承包经营权可以依法采取转让、出租、入股、抵押或者其他方式流转。