新版个税申报流程如下：

1、新个人所得税实施后，就不能在原系统电子税务局上申报了，如果要进行申报，先登陆电子税务局，登陆后，进入个人所得税模块，找到申报初始密码。

2、找到申报初始密码后，下载新个人所得税申报系统【自然人税收管理系统扣缴客户端】，下载好后，进行安装初始化，这些都很简单，按照系统提示就可以了。

3、新个税的新系统安装好后，输入设置的登录密码，点击登录，就可以进入新个税系统了。

4、进入新系统后，首先做人员信息采集，就是录入公司人员的个人信息，包括人员姓名、身份证号等，点击添加就可以录入了，也可以用导入功能。

5、公司员工信息采集好后，点击【扣缴所得税报告表填写】，进入填写界面后，有三个分类，如果是申报平时的工资，点击【正常工资薪金】就可以了。