深圳有港澳通行证自助签注机的有：

1、市公安局出入境处办证大厅（解放路4016号）；

2、深圳市公安局出入境管理处梅林自助服务大厅地址：深圳市福田区梅林路与凯丰路交汇处。这是2015年8月份启用的；

二、值得提醒自助签注的朋友们注意的是：前往自助服务大厅打印签注前，须确认查询结果为“证件正在制作过程中”，意思是必须先在网上申请，待办证结果为“证件正在制作过程中”再去自助打印；

办理专柜上方有“自助通关信息采集”的指示牌的。办理的流程只是填一张信息表格就可以申请了，信息表格在专柜那里自己拿的。基本上5分钟就可以办好的。

还有一点需要注意的是，“港澳通行证”必须是使用过一次前往香港的。新的港澳通行证是不能办的，要去一次香港后才可以办理自助通关。