离婚时有两个孩子，法庭会根据不同情况作出不同的判决。根据《婚姻法》的规定，夫妻双方离婚的，如果孩子还在哺乳期内，离婚时孩子应当判归女方抚养。

《最高人民法院关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》规定，人民法院审理离婚案件，对子女抚养问题；应当依照《中华人民共和国婚姻法》第二十九条、第三十条及有关法律规定，从有利于子女身心健康，保障子女的合法权益出发，结合父母双方的抚养能力和抚养条件等具体情况妥善解决。