股权转让合同履行纠纷的处理方式：如果发生一方请求另一方履行合同的时候，另一方没办法履行，就会要有一方需要支付转让股权的赔偿金或者支付违约金。

【法律依据】

《公司法》第七十一条规定：有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满30日未答复的，视为同意转让。