农村土地承包经营权确权登记方式有以家庭承包方式承包的农村土地和以其他方式承包的农村土地。

【法律依据】

《农村土地承包法》第四十九条，以其他方式承包农村土地的，应当签订承包合同，承包方取得土地经营权。当事人的权利和义务、承包期限等，由双方协商确定。以招标、拍卖方式承包的，承包费通过公开竞标、竞价确定；以公开协商等方式承包的，承包费由双方议定。