农村自建房也需要办理土地证，土地证是土地所有者或者土地使用者，享有土地所有权或者使用权的法律依据。如果原土地证上土地的来源是转让的，就只要缴纳手续费。

【法律依据】

《土地管理法》第十一条规定，农民集体所有的土地，由县级人民政府登记造册，核发证书，确认所有权。