建养殖厂土地使用证的过户流程：

1.申请登记。

2.地籍调查。由国土资源局派人到实地调查，全面核实土地登记申请的内容，计算宗地面积，绘制宗地图。

3.权属审核。由国土资源局专职人员对申请登记的土地权属性质、用途权属来源、宗地面积等进行审核。

4.注册登记。填写《土地登记卡》、《土地归户卡》和《土地使用证》。

5.颁发土地证书。

【法律依据】

《土地管理法》第十一条，农民集体所有的土地，由县级人民政府登记造册，核发证书，确认所有权。