合同诈骗立案撤销案件，公安机关应当报经上级领导审查批准，然后写出撤销案件报告。检察机关在办理直接受理侦查的刑事案件，对依法不应追究刑事责任的被告人，可以决定撤销案件。对决定撤销的案件，应制作撤销案件决定书。公安机关对决定撤销的案件，应写出“撤销案件通知书”，报送检察机关。

【法律依据】

《公安机关办理刑事案件程序规定》第一百八十三条规定，经过侦查，发现具有下列情形之一的，应当撤销案件：

(一)没有犯罪事实的;

(二)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;

(三)犯罪已过追诉时效期限的;

(四)经特赦令免除刑罚的;

(五)犯罪嫌疑人死亡的;

(六)其他依法不追究刑事责任的。