分居两年，法院并不必然会直接判离婚。根据法律规定因感情不和分居满两年，法院经调解无效的可以判决离婚。

也就是说如果分居已经满两年时间，再加上有证据证明夫妻双方感情已经破裂并没有再和好的可能性；

比如重婚、其中一方或者双方有与他人人同居、实施家庭暴力、虐待、吸毒、赌博等恶习，或者有一方有严重的生理缺陷不能进行性生活等，那么法院就会判决双方离婚。

【法律依据】我国 《婚姻法》第三十二条第二款规定，人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：

(一)重婚或有配偶者与他人同居的；

(二)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的；

(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改的；

(四)因感情不和分居满二年的；

(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。 

 一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。