私下签订的股权转让协议，如果没有法律规定的无效事由，通常是有效的。但是私下签订协议可能会影响到协议的履行。根据《公司法》第71条的规定，股东之间可以相互转让全部或者部分股权，股东向股东以外的人转让股权，需要其他股东过半数同意，其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该股权，不购买视为同意转让。因此，如果是股东之间私下签订股权转让协议，那么该协议不光有效，而且能够办理工商登记。但是，如果股东和股东之外的人签订股权转让协议却没有通知其他股东，即便买方支付了股权转让款，也无法到工商部门办理股权变更登记，此时这个股权转让协议是没有办法履行的。