股权转让原值是以增资的方式，实际增加公司的资产，也可以同时增加注册资本，公司的股权结构也发生相应变化。如果是股东转让股权，则交易仅发生在原股东和新股东之间，股权结构也发生变化，但公司资产和注册资本不变。
根据《股权转让所得个人所得税管理办法》第十六条，股权转让人已被主管税务机关核定股权转让收入并依法征收个人所得税的，该股权受让人的股权原值以取得股权时发生的合理税费与股权转让人被主管税务机关核定的股权转让收入之和确认。