车辆损失险的保险标的为被保险车辆本身，不包括车上运输的货物，因此：

被保险车辆的损失：若您投保的车辆损失险包含自燃责任（目前多数商业车损险已将自燃纳入保障范围），保险公司会按照保险合同约定，赔偿车辆因自燃导致的损失。

受损货物的损失：仅投保车辆损失险的情况下，保险公司不对货物损失承担赔偿责任，货物损失需要您自行承担，若有其他责任主体（如车辆质量问题导致自燃），您可向责任主体另行追偿。

根据《中华人民共和国保险法》第二十二条规定：保险事故发生后，按照保险合同请求保险人赔偿或者给付保险金时，投保人、被保险人或者受益人应当向保险人提供其所能提供的与确认保险事故的性质、原因、损失程度等有关的证明和资料。保险人按照合同的约定，认为有关的证明和资料不完整的，应当及时一次性通知投保人、被保险人或者受益人补充提供。

结合该规定，您申请理赔需要做好以下准备：

及时固定证据：事故发生后立即报警、通知保险公司，留存火灾事故认定书、车辆受损照片/视频、车辆维修清单等材料，用以确认事故是车辆自燃导致，以及明确车辆损失程度。

按要求提交材料：按照保险公司要求提交索赔申请、保单信息、身份证明、驾驶证行驶证等材料，如果材料不全，保险公司会一次性通知您补充，您按要求补正即可。

处理时限要求：根据《中华人民共和国保险法》第二十三条规定：保险人收到被保险人或者受益人的赔偿或者给付保险金的请求后，应当及时作出核定；情形复杂的，应当在三十日内作出核定，但合同另有约定的除外。保险人应当将核定结果通知被保险人或者受益人；对属于保险责任的，在与被保险人或者受益人达成赔偿或者给付保险金的协议后十日内，履行赔偿或者给付保险金义务。如果保险公司超出时限未处理，您有权要求保险公司赔偿您因此遭受的额外损失。

三、后续实操建议

确认保险责任：先查看您的车辆损失险保单，确认是否明确将自燃列为承保范围，部分早期单独投保的车损险不包含自燃责任，若未包含则车辆损失也无法获赔。

追责备选路径：如果车辆自燃是因车辆本身质量缺陷导致，您可以就车辆损失和货物损失，向车辆的生产者、销售者主张侵权赔偿。

争议处理：如果保险公司无正当理由拒赔，您可以先向银保监会投诉，仍无法解决的可通过向法院起诉维护自身合法权益。

法律依据

《最高人民法院关于适用《中华人民共和国保险法》若干问题的规定(三)》第二十二条 保险法第四十五条规定的“被保险人故意犯罪”的认定，应当以刑事侦查机关、检察机关和审判机关的生效法律文书或者其他结论性意见为依据。

《最高人民法院关于适用《中华人民共和国保险法》若干问题的规定(三)》第二十三条 保险人主张根据保险法第四十五条的规定不承担给付保险金责任的，应当证明被保险人的死亡、伤残结果与其实施的故意犯罪或者抗拒依法采取的刑事强制措施的行为之间存在因果关系。
被保险人在羁押、服刑期间因意外或者疾病造成伤残或者死亡，保险人主张根据保险法第四十五条的规定不承担给付保险金责任的，人民法院不予支持。