员工自动离职,是指没有申请辞职的情况下没有到单位上班旷工被单位辞退。单位是可以以此扣除员工奖励性待遇,但是工资部分是不能扣除的,如果员工行为造成公司直接经济损失,可以扣员工工资部分抵扣损失。所以到底扣多少是需要根据工作结构以及是否存在损失计算的。根据《工资支付暂行条例》第十六条: 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的,用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿,可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。