发现自己的车牌被套牌了的处理方式是：首先，搜集一切对自己有利的证据；然后，向交管部门提交申诉在收集到以上的证据，然后到交管部门去提出车辆被套牌申诉；申请更换车辆牌号申诉成功后，交管部门会开具车辆被套牌说明。
