非法持有毒品原植物种子罪的处罚: 1、一般情况下,非法持有未灭活的毒品原植物种子,数量较大,构成犯罪的,会判处三年以下有期徒刑、拘役或管制,并处或单处罚金。 2、非法持有毒品原植物种子罪的对象为,未灭活的毒品原植物种子;未灭活的,即持有灭活毒品原植物的种子不构成本罪。