公司经营异常会被罚款。只要企业两年以上年报异常就会被罚款的,企业会由县级以上工商行政管理部门列入经营异常名录,通过企业信用信息公示系统向社会公示,目的是为了提醒企业依法履行经营义务,企业经营异常情节严重的有关主管部门会依照有关法律、行政法规规定给予企业行政处罚。