仲裁协议约定了两个仲裁机构,仲裁协议是否有效需要具体分析某些仲裁条款可能约定两家或两家以上的仲裁机构，仲裁协议约定两个以上仲裁机构的，当事人可以协议选择其中的一个仲裁机构申请仲裁；当事人不能就仲裁机构选择达成一致的，仲裁协议无效。根据《仲裁法》第七条，仲裁应当根据事实，符合法律规定，公平合理地解决纠纷。