分摊到所属月份扣税。
关于关于补发工资个人所得税问题，国家税务总局在这方面没有明确规定，根据《个人所得税法》的规定，个人应于取得所得时缴纳个人所得税，因此，所在单位补发工资，应于补缴当月缴纳个人所得税。对此，各地有具体规定，按照各地的规定，补发的工资，应当分摊到所属月份与原工资合并计算扣缴个人所得税。
计算公式为：
所属月份补发工资应纳税额{(所属月份补发工资原所属月份的工资薪金所得)个人应纳的五险一金费用减除额×适用税率-速算扣除数}原所属月份已缴纳的个人所得税。