感染病毒或者疑似感染的员工拒不接受医学检查，用人单位的处理方式是可以要求其前往医院接受检查和治疗，如果员工拒不配合，用人单位可以报告给医疗机构或者公安机关，由公安机关协助医疗机构采取强制隔离治疗措施根据《传染病防治法》第三十九条，拒绝隔离治疗或者隔离期未满擅自脱离隔离治疗的，可以由公安机关协助医疗机构采取强制隔离治疗措施。