由于小产权房的特殊法律属性，使得小产权房的流通转让存在很多的限制，买小产权房子不能受到法律的认可与保护，也就不能办理土地使用证、房产证等合法手续。由于小产权房的特殊法律属性，购买时需要签订的手续目前没有相关规定，也不能按照商品房买卖来办理相关手续。
集体土地上所建的小产权房，因为《土地法》等相关规定明确规定，集体土地的宅基只能用于本集体经济组织成员，所以，如果不是该集体组织成员的话，购买该类型的房屋是不合法的，将来发生拆迁补偿的话，权益无法得到保护。