重庆特病办理流程如下：

1、申报人填写《重庆市城乡居民合作医疗保险特殊疾病申请表》，并提交至医保中心；

2、申报人身份证复印件、代办人身份证复印件、近期1寸照片2张；

3、申报人提供二级以上医院住院病历或三级医院门诊病历（含检查原始资料）即可现场办理《重庆市医疗保险特殊疾病资格证》；

4、若无二级以上医院住院病历或三级医院门诊病历，则需填写《重庆市城乡居民合作医疗保险特殊疾病申请表》申请参加集中体检，合格后，方能办理《重庆市医疗保险特殊疾病资格证》。

一般情况下，申请特病资格需要经过集中诊断，向参保地区县社保局申报时，可以自己申报，也可委托他人申报，接受申报的区县社保局会通知体检时间和医院，进行集中诊断。

一些重大疾病的特病资格不需要经过集中诊断，可以直接到社保局指定医院申请诊断。参保人员申请以下疾病的特病资格，不需要经过集中诊断。