协议变更孩子抚养权的应该到住所所在地有管辖权的公证处办理公证，但实际上协议变更孩子抚养权的没有多大的必要去办理公证，协议变更抚养权不是非征得有关部门的同意。

一般来说，变更孩子抚养权是否需要公证由离婚夫妻自己决定，因为，变更孩子抚养权可以先有离婚夫妻协商，协商不成可以提起诉讼解决;如果协商后订立变更孩子抚养权协议书，或者进行变更孩子抚养权协议书公证的，是法律允许的，但是，无论怎么样，最后都需要法院裁定确认更孩子抚养权协议，才具有法律效力。

《最高人民法院关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》规定：父母双方协议变更子女抚养关系的，应予准许。