有争议的双重劳动关系处理方法：

1、停止办理职工停薪留职手续。

2、不得再为职工办理挂名手续。

3、解决好两不找职工劳动关系。

4、企业必须严格执行国家关于内部离岗退养的规定。

5、严格执行国家对职工“医疗期”规定。

6、加强对学习、培训人员的管理。

7、彻底清理外出劳务人员。

8、取消外借建立合理流动制度。

9、绝不允许企业给职工放长假。

10、各级政府还应制定用工制约措施。

【法律依据】

最高人民法院《关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释(三)》第八条规定：企业停薪留职人员、未达到法定退休年龄的内退人员、下岗待岗人员以及企业经营性停产放长假人员，因与新的用人单位发生用工争议，依法向人民法院提起诉讼的，人民法院应当按劳动关系处理。