股权转让协议纠纷管辖权的确定：根据合同法的规定，产生股权转让纠纷由被告所住地或是股权转让目标公司的注册地法院来管辖。

【法律依据】

《民事诉讼法》第三十四条，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。