农村房屋土地使用证的办理流程：

1、向村委会写出书面申请。

2、填写申请表。

3、乡镇政府审核：乡镇政府根据上报资料到现场进行勘测。

4、县国土资源局接件后，进行资料审核并到现场进行勘测。

5、审核、勘测合格后，报县政府进行审批。

6、审批后张榜公示7日无异议的，国土资源所到现场定点放线，准予开工建设。

7、建设完工后，报国土资源所验收。

【法律依据】《物权法》第九条规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力。