员工自动离职是否支付经济补偿金，要区分情况决定。如果是劳动者主动提出离职的，没有经济补偿。如果是因公司违反劳动合同法第三十八条规定而离职的，可以要求经济补偿。

【法律依据】《劳动合同法》第四十六条：劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。