根据《最高人民法院关于审理涉及国有土地使用权合同纠纷案件适用法律问题的解释》第十条规定，处理土地使用权转让纠纷的方式有：

1、已经办理土地使用权变更登记手续的受让方，请求转让方履行交付土地等合同义务的，应予支持；

2、均未办理土地使用权变更登记手续，已先行合法占有投资开发土地的受让方请求转让方履行土地使用权变更登记等合同义务的，应予支持；

3、均未办理土地使用权变更登记手续，又未合法占有投资开发土地，先行支付土地转让款的受让方请求转让方履行交付土地和办理土地使用权变更登记等合同义务的，应予支持；

4、合同均未履行，依法成立在先的合同受让方请求履行合同的，应予支持。