职工失踪公司是否要承担责任要根据具体情况而定，如果员工是在上班时间失踪的，需由单位履行报案、报险、善后等义务，最后案件确认后按实际情况分别处理，如属个人行为，与公司无关的，公司不需要赔偿。

【法律依据】

《民法总则》第四十条规定，自然人下落不明满二年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告该自然人为失踪人。