对新发现的突发传染病宣布为甲类传染病的应当经过的程序是：国家卫生计生委《突发公共卫生事件与传染病疫情监测信息报告管理办法》规定：

责任报告单位对甲类传染并乙类传染病中的传染性非典型肺炎、肺炭疽的病人、病原携带者或疑似病人，城镇应于6小时内、农村应于12小时内，通过传染病疫情监测信息系统进行报告。