证券交易所债券交易的程序如下：
1、投资者委托证券商买卖债券，签订开户契约，填写开户有关内容，明确经纪商与委托人之间的权利和义务；
2、证券商通过它在证券交易所内的代表人或代理人，按照委托条件实施债券买卖业务；
3、办理成交后的手续；
4、经纪商核对交易记录办理清算交割手续。