根据税法规定，分公司是非独立纳税人，自行向税务机关申报即可。其亏损可以由总公司的利润弥补；总公司可以把其效益好的资产转移给子公司，把不良资产处理掉。公司应当在每一会计年度终了时编制财务会计报告，并依法经会计师事务所审计。

法律依据

《公司法》第一百六十四条 【财务会计报告】公司应当在每一会计年度终了时编制财务会计报告，并依法经会计师事务所审计。
财务会计报告应当依照法律、行政法规和国务院财政部门的规定制作。