企业并购融资制度存在的问题有: 1.银行信贷管理体制对并购贷款的限制缺乏灵活性。 2.上市公司并购非上市公司后如何解决新增资部分的上市便存在障碍,为完成并购而发行股票也受到制约。 3.企业债券的发行同股票一样实行计划额度管理,且审批过程繁琐严格,影响并购融资的时间要求。 【法律依据】 《股票发行与交易管理暂行条例》第四十三条,任何金融机构不得为股票交易提供贷款。