病假期间会对员工进行一定的工资的扣除，企业职工在医疗期内，其病假工资、疾病救济费和医疗待遇按照有关规定进行执行。在医疗期内企业支付的病假工资标准不得低于最低工资标准的80%。通常可以按照每日工资的80%执行。根据相关法律规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80％。
如果遇到公司侵犯自己权益的，一定要去劳动局进行仲裁，申请仲裁的程序是：首先，要符合申请仲裁的条件，需要有有仲裁协议；有具体的仲裁请求和事实、理由；属于仲裁委员会的受理范围。然后，当事人要向仲裁委员会递交仲裁协议、仲裁申请书及副本。最后，仲裁委员会对符合条件的进行仲裁。
律师建议大家，如果想让自己的合法权益受到保障，一定要合理的利用法律的武器，跟无良公司做斗争，否则，公司会愈发得寸进尺的侵犯劳动者的合法权益。
法律法规
《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第五十九条:职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80％。