单位申请工伤认定程序为：
(一)30日内向劳动部门申报。根据《工伤保险条例》第十七条，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
(二)提交相关资料。《工伤保险条例》第十八条，提出工伤认定申请应当提交下列材料：
1、工伤认定申请表；
2、与用人单位存在劳动关系(包括事实劳动关系)的证明材料；
3、医疗诊断证明或者职业病诊断证明书(或者职业病诊断鉴定书)。
(三)符合相关法定情形即认定为工伤。
(四)60天作出工伤认定决定。根据《工伤认定办法》第十八条，社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定决定，出具《认定工伤决定书》或者《不予认定工伤决定书》。