农村自建房房产证办理流程如下：
1、建房户向村委会提出建房申请2、村委会审核同意，签字盖章3、向乡乡建办提出申请4、乡建办工作人员实地踏看，同意建房5、到乡乡建办领取房屋建设申请表6、经乡建办签字同意7、乡主管领导签字盖章，核实同意8、交县规划建设局审批（县行政服务中心）9、建房户领取产权证。