区别如下：审查内容不同。形式审查是国家商标局对商标申请文件形式合法性审查，对商标申请书件的填写是否属实、准确、清晰、是否规范、有没有按国家的统一要求填写以及有关手续是否完备进行审查；实质审查是指国家商标局对商标按其申请日期的先后，通过检索、分析、对比，审查该商标注册的合法性。

【法律依据】

《商标法》第28条，对申请注册的商标，商标局应当自收到商标注册申请文件之日起九个月内审查完毕，符合本法有关规定的，予以初步审定公告。

《商标法》第29条，在审查过程中，商标局认为商标注册申请内容需要说明或者修正的，可以要求申请人做出说明或者修正。申请人未做出说明或者修正的，不影响商标局做出审查决定。