企业债权超过诉讼时效在有些情况下还可以受到保护，例如债务人自愿履行债务的，双方重新达成协议，债务人在催收通知上签章的，债务人向债权人出具还款计划书、承诺书或询证函的。

【法律依据】

《关于超过诉讼时效期间后债务人向债权人发出确认债务的询证函的行为是否构成新的债务的请示的答复》，债务人于诉讼时效期间届满后主动向债权人发出询证函核对债务的行为，视为重新确认债务，债权受法律保护。