刑事赔偿的赔偿机关的确定：依法应当赔偿的案件，批准逮捕与提起公诉的如不是同一人民检察院，赔偿义务机关为批准逮捕的人民检察院。

【法律依据】

《国家赔偿法》第19条规定，中国刑事赔偿义务机关依照不同的情况分别是公安机关、国家安全机关、军队保卫部门以及检察机关、审判机关和监狱管理部门。具体而言，中国刑事赔偿义务机关按照下列原则予以确定：

(一)对没有犯罪事实或者没有事实证明有犯罪重大嫌疑的人错误拘留，作出拘留决定的机关为赔偿义务机关;

(二)对没有犯罪事实的人错误逮捕的，作出逮捕决定的机关为赔偿义务机关;

(三)再审改判无罪的，作出原生效判决的人民法院为赔偿义务机关;

(四)二审改判无罪的，作出一审判决的人民法院和作出逮捕决定的机关为共同赔偿义务机关;

(五)刑讯逼供、殴打或者以其他暴力行为造成身体伤害或者死亡的，或者违法使用武器、警械造成公民身体伤害或者死亡的，作出上述违法行为的工作人员所属的机关为赔偿义务机关。