根据《房屋登记办法》的规定，因合法建造房屋申请房屋所有权初始登记的，办理流程如下：

(一) 申请人提交下列材料提出申请；

(二) 受理，提交农村房产证办理需要提交的材料后，工作人员会受理；

(三) 公告；

(四) 审核；

(五) 收费；

(六) 记载于登记簿；

(七) 发证申请村民住房所有权初始登记的，还应当提交申请人属于房屋所在地农村集体经济组织成员的证明。