因国家赔偿纠纷提起行政诉讼的，管辖法院的确定原则是：

1、地域管辖：根据《行政诉讼法》第十八条规定，若未经复议，直接起诉的，则由最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院管辖；

若国家赔偿案件经过行政机关复议的，则原告既可以到最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院起诉；也可以到复议机关所在地人民法院起诉。

2、级别管辖：根据《行政诉讼法》规定，原则上应到基层人民法院起诉。