合同变更协议何时生效由当事人协商一致约定，或依法律规定。

【法律依据】

《合同法》第七十七条，当事人协商一致，可以变更合同。法律、行政法规规定变更合同应当办理批准、登记等手续的，依照其规定。

第七十八条，当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。