双方在协议离婚时，若协议离婚后房产由一方过户于另一方，此种情形下，如果双方在协议签署后均无二意，对方也愿意配合办理过户手续，那么按照正常的程序递交材料就行了；如遇对方不配合，协议确认的房屋归属人可通过诉讼或仲裁（若有有效的仲裁协议条款）方式解决争议，即以对方违约为由，请求对方按照协议约定履行配合房产过户的义务，在法院作出生效判决后，如果对方仍不履行，可以申请法院强制执行，通常法院会向房管部门送达协助执行通知书，房管部门在收到通知书后即会根据相关流程办理过户手续。