要是属于政府强制隔离的情况，员工没有违规违法情况的，如果是员工私人原因造成需要隔离的，其隔离期工资发放有以下两种选择：
一、隔离期间协商过后可以通过网络在家办公的，公司按照正常上班出勤给员工支付薪水。
二、隔离期不能办公的，公司需要支付给员工基本工资、岗位工资等固定工资成分;绩效、提成、奖金、车补、饭补等非固定工资成分可不支付。
如果属于居家隔离、两地出行导致的隔离等非政府强制隔离，这种隔离并不是《传染病防治法》所说的隔离，其薪水发放情况有两种选择：
一、隔离期间经过协商可以灵活在家办公的，公司应该按正常出勤给员工支付薪水。
二、隔离期不能办公的，其工资发放情况有以下两种选择：
1、企业和员工协商一致，(以企业意向为主)合理给员工安排使用带薪假期，譬如公休假、年假等，或者是公司自设的福利假等等(不包括事假)，这些假期都是带薪假，所以公司要支付员工全额的工资。休完带薪假还是无法上班的，按照方法2执行。
2、要是公司没有安排员工使用带薪假期的，员工不上班时间在一个工资支付周期(通常一个月)以内的，公司给员工支付固定成分的工资(基本工资、岗位工资);超出一个工资支付周期的，企业给员工发生活费。
此外还有两种特殊的情况：
1、如果是因为工作原因导致的隔离，企业应当按照员工正常出勤上班，全额发放工资。
2、如果是由于员工违法违规不遵守防控要求而造成的隔离，这种情况劳动者主张劳动报酬的，是不予支持的。

法律依据

《《传染病防治法》》第四十一条 对已经发生甲类传染病病例的场所或者该场所内的特定区域的人员，所在地的县级以上地方人民政府可以实施隔离措施，并同时向上一级人民政府报告；接到报告的上级人民政府应当即时作出是否批准的决定。 上级人民政府作出不予批准决定的，实施隔离措施的人民政府应当立即解除隔离措施。 在隔离期间，实施隔离措施的人民政府应当对被隔离人员提供生活保障；被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。 隔离措施的解除，由原决定机关决定并宣布。